Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clstn3Q99JH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn3Q99JH7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms