Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Csmd1Q923L3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csmd1Q923L3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Csmd1Q923L3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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