Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trim59Q922Y2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim59Q922Y2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms