Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Clip1Q922J3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Clip1Q922J3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Clip1Q922J3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.4 ms