Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HlcsQ920N2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HlcsQ920N2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms