Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarca5Q91ZW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarca5Q91ZW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarca5Q91ZW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms