Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx18Q91ZR2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms