Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpe65Q91ZQ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpe65Q91ZQ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms