Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps3Q91VB4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hps3Q91VB4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms