Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn4Q8VCH8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms