Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ApobrQ8VBT6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ApobrQ8VBT6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms