Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Nup35Q8R4R6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nup35Q8R4R6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms