Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sumf1Q8R0F3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sumf1Q8R0F3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms