Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TprkbQ8QZZ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TprkbQ8QZZ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms