Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxc12Q8K5B8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc12Q8K5B8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms