Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Colec12Q8K4Q8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colec12Q8K4Q8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms