Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
OptnQ8K3K8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OptnQ8K3K8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OptnQ8K3K8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms