Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ncapd2Q8K2Z4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ncapd2Q8K2Z4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms