Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shtn1Q8K2Q9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shtn1Q8K2Q9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shtn1Q8K2Q9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms