Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Fbxo18Q8K2I9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Fbxo18Q8K2I9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Fbxo18Q8K2I9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Fbxo18Q8K2I9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo18Q8K2I9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Fbxo18Q8K2I9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Fbxo18Q8K2I9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Fbxo18Q8K2I9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo18Q8K2I9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms