Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr1eQ8K202 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1eQ8K202 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms