Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sde2Q8K1J5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sde2Q8K1J5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms