Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf628Q8CJ78 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf628Q8CJ78 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms