Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SbsnQ8CIT9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SbsnQ8CIT9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SbsnQ8CIT9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SbsnQ8CIT9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms