Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm28Q8CGC6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rbm28Q8CGC6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbm28Q8CGC6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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