Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf17Q8CFA7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klf17Q8CFA7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms