Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc178Q8CDV0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc178Q8CDV0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms