Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lrrc9Q8CDN9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lrrc9Q8CDN9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms