Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf20l1Q8CCJ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf20l1Q8CCJ9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms