Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ufl1Q8CCJ3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ufl1Q8CCJ3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms