Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Podxl2Q8CAE9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Podxl2Q8CAE9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms