Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8C5C9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8C5C9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms