Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Znf428Q8C1M2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Znf428Q8C1M2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Znf428Q8C1M2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Znf428Q8C1M2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Znf428Q8C1M2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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Znf428Q8C1M2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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Znf428Q8C1M2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf428Q8C1M2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf428Q8C1M2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf428Q8C1M2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf428Q8C1M2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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