Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Camsap2Q8C1B1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Camsap2Q8C1B1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Camsap2Q8C1B1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms