Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc21aQ8C0S4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc21aQ8C0S4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc21aQ8C0S4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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