Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FarsaQ8C0C7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FarsaQ8C0C7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FarsaQ8C0C7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FarsaQ8C0C7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FarsaQ8C0C7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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FarsaQ8C0C7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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FarsaQ8C0C7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
FarsaQ8C0C7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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