Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slx1bQ8BX32 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slx1bQ8BX32 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx1bQ8BX32 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms