Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TtpaQ8BWP5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TtpaQ8BWP5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TtpaQ8BWP5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms