Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm4aQ8BW72 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm4aQ8BW72 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms