Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nup54Q8BTS4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nup54Q8BTS4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms