Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT42

Smim5, Small integral membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim5Q8BT42 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smim5Q8BT42 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smim5Q8BT42 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smim5Q8BT42 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms