Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPQ7

Sgsm1, Small G protein signaling modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm1Q8BPQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sgsm1Q8BPQ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sgsm1Q8BPQ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms