Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Usp54Q8BL06 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp54Q8BL06 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp54Q8BL06 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.8 ms