Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc2Q8BKV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpc2Q8BKV1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms