Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rufy1Q8BIJ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy1Q8BIJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy1Q8BIJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms