Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bhlhe23Q8BGW3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms