Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trmt12Q8BG71 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trmt12Q8BG71 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trmt12Q8BG71 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trmt12Q8BG71 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trmt12Q8BG71 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms