Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem39bQ810L4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem39bQ810L4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms