Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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Pcsk9Q80W65 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pcsk9Q80W65 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Pcsk9Q80W65 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Pcsk9Q80W65 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Pcsk9Q80W65 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Pcsk9Q80W65 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pcsk9Q80W65 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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