Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thnsl2Q80W22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thnsl2Q80W22 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms